Василий Александрович Филипенко родился 15 января 1973 года в городе Омске. В 1997 году получил высшее образование, окончив Тюменскую государственную архитектурно-строительную академию по специальности промышленное и гражданское строительство.

В 1993 году поступил на работу мастером участка в Окружное государственное предприятие «УПТОиК». С 1995 по 2002 годы трудился в Управлении капитального строительства Ханты-Мансийского автономного округа-Югры. В управлении капитального строительства В.А. Филипенко прошел путь от ведущего специалиста до заместителя начальника отдела контроля.

С 2002 по 2006 год работал первым заместителем директора Департамента строительства Ханты-Мансийского автономного округа -Югры.

В 2006 году был избран депутатом, Председателем Думы города Ханты-Мансийска 4 созыва. В 2011 году избран депутатом по второму избирательному округу,а  затем Главой города Ханты-Мансийска - исполняющим полномочия Председателя Думы города Ханты-Мансийска.

В ноябре 2015 года назначен на пост Генерального директора Хоккейного клуба "Югра".